1996年に第1回大会が行われている。各地区予選を勝ち抜いたチームが、トーナメント方式で行う。決勝ラウンドは第12回まで駒沢体育館、第13回以降は国立代々木第一体育館にて開催される。（2006年以降1次ラウンドは関西などで開催されている。また、2007年の1回戦は舞洲アリーナで開催。）
初期には日産自動車、その後は日本ハム、2004年はファミリーマートが冠スポンサーになったが、2005年以降はプーマがスポンサーになっていることからプーマカップとして行われている。
2006年からは決勝ラウンドにおいて男女混合フットサル大会「プーマユニミックスカップ」のエキシビションも開催されている。
| 回 | 年度 | 優勝 |
|---|---|---|
| 1 | 1996年 | ルネス学園甲賀サッカークラブ |
| 2 | 1997年 | 府中水元クラブ |
| 3 | 1998年 | ルネス学園甲賀サッカークラブ |
| 4 | 1999年 | FIRE FOX IPANEMA'S |
| 5 | 2000年 | FIRE FOX IPANEMA'S |
| 6 | 2001年 | CASCAVEL BANFF |
| 7 | 2002年 | FIRE FOX |
| 8 | 2003年 | P.S.T.C LONDRINA |
| 9 | 2004年 | BANFF TOHOKU |
| 10 | 2005年 | FIRE FOX |
| 11 | 2006年 | PREDATOR |
| 12 | 2007年 | 大洋薬品/BANFF |
| 13 | 2008年 | バルドラール浦安 |
| 14 | 2009年 | FUGA MEGURO |
| 15 | 2010年 | シュライカー大阪 |
| 16 | 2011年 | 中止 |
| 17 | 2012年 | シュライカー大阪 |
| 18 | 2013年 | 名古屋オーシャンズ |
